Fra denne sæson blev gruppespillet igen afskaffet. Følgende hold sad over i 1. runde:

Nord: Crewe Alexandra, Lincoln City, Mansfield Town, Scunthorpe United, Shrewsbury Town, Wigan Athletic, Wrexham og York City.

Syd: Barnet, Bristol City, Exeter City, Northampton Town, Peterborough United, Torquay United, Walsall og Watford.

Football League Trophy, 1996-97, kampe Grupper | Dato
1. runde, Nord < 1995-96 | 1997-98 >
Mandag 9. december 1996  
  (3) 0-2 (3) 0
Tirsdag 10. december 1996  
  (3) 3-1 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
  (4) 2-0 (4) 0
  (4) 1-2 (3) 0
  (4) 0-2 (3) 0
  (4) 3-1 (4) 0
  (3) 0-1 (3) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
  (4) 0-1 (3) 0
 
1. runde, Syd < 1995-96 | 1997-98 >
Lørdag 7. december 1996  
  (4) 0-4 (3) 0
Tirsdag 10. december 1996  
  (3) 1-2 (3) 0
  (4) 0-1 (4) 0
  (3) 1-2 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
  (3) 2-1 (4) 0
  (3) 2-0 (3) 0
Tirsdag 17. december 1996  
  (4) 3-2 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
Onsdag 8. januar 1997  
  (4) 1-1 (3) 0
      [efs, ord. tid: 0-0] [str.:6-5]      
  Swansea City videre efter forlænget spilletid og straffesparkskonkurrence.  
 
2. runde, Nord < 1995-96 | 1997-98 >
Mandag 13. januar 1997  
  (3) 6-0 (4) 0
Tirsdag 14. januar 1997  
  (3) 4-0 (4) 0
  (3) 3-2 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
Tirsdag 21. januar 1997  
  (3) 1-0 (3) 0
Tirsdag 28. januar 1997  
  (4) 4-0 (4) 0
  (4) 1-1 (3) 0
      [efs, ord. tid: 0-0] [str.:4-2]      
  Scunthorpe United videre efter forlænget spilletid og straffesparkskonkurrence.  
  (3) 0-1 (3) 0
Tirsdag 4. februar 1997  
  (3) 0-1 (3) 0
 
2. runde, Syd < 1995-96 | 1997-98 >
Tirsdag 7. januar 1997  
  (3) 2-1 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
  (3) 2-3 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
  (3) 2-1 (4) 0
Tirsdag 14. januar 1997  
  (4) 1-1 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0] [str.:2-4]      
  Exeter City videre efter forlænget spilletid og straffesparkskonkurrence.  
  (3) 1-0 (4) 0
Tirsdag 21. januar 1997  
  (3) 2-0 (3) 0
  (4) 0-1 (3) 0
Tirsdag 4. februar 1997  
  (4) 1-0 (3) 0
 
3. runde, Nord < 1995-96 | 1997-98 >
Tirsdag 4. februar 1997  
  (3) 1-0 (3) 0
  (3) 0-2 (4) 0
Tirsdag 11. februar 1997  
  (3) 1-2 (3) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
  (3) 2-1 (4) 0
      [efs, ord. tid: 0-0]      
 
3. runde, Syd < 1995-96 | 1997-98 >
Tirsdag 28. januar 1997  
  (3) 0-1 (4) 0
  (4) 0-1 (3) 0
Tirsdag 11. februar 1997  
  (3) 0-2 (4) 0
  (3) 2-1 (3) 0
 
Del-semifinaler, Nord < 1995-96 | 1997-98 >
Tirsdag 18. februar 1997  
  (3) 1-2 (4) 0
Tirsdag 4. marts 1997  
  (3) 1-1 (3) 0
      [efs, ord. tid: 0-0] [str.:3-5]      
  Stockport County videre efter forlænget spilletid og straffesparkskonkurrence.  
 
Del-semifinaler, Syd < 1995-96 | 1997-98 >
Tirsdag 18. februar 1997  
  (4) 2-1 (4) 0
  (3) 0-1 (3) 0
 
Del-finale, Nord < 1995-96 | 1997-98 >
  1. kamp  
Tirsdag 18. marts 1997  
  (4) 2-0 (3) 7.057
 
  2. kamp  
Tirsdag 25. marts 1997  
  (3) 0-0 (4) 8.593
  Carlisle United videre med 3-2 samlet.  
 
Del-finale, Syd < 1995-96 | 1997-98 >
  1. kamp  
Tirsdag 11. marts 1997  
  (3) 2-0 (4) 4.556
 
  2. kamp  
Tirsdag 18. marts 1997  
  (4) 3-0 (3) 4.705
  Colchester United videre med 3-2 samlet.  
 
Finale < 1995-96 | 1997-98 >
Søndag 20. april 1997  
16.00 (4) 0-0 (4) 45.077
      [efs] [str.:4-3]      
  Vinder af Football League Trophy 1996-97: Carlisle United (1. titel)