For anden sæson i træk blev play-off lavet om. Denne gang gik finalerne fra to kampe - ude og hjemme - til én afgørende finale på neutral grund, Wembley Stadium i London.

Football League, Division Three play-off, 1989-90, kampe
< 1988-89 | 1990-91 >
Semifinaler
Søndag 13. maj 1990
16.00 1-1 15.108
16.00 0-0 7.019
Onsdag 16. maj 1990
20.30 2-0 10.343
  Tranmere Rovers kvalificeret til finalen med 2-0 samlet.  
20.45 2-0 15.200
  Notts County kvalificeret til finalen med 3-1 samlet.  
Finale
Søndag 27. maj 1990
16.00 2-0 29.252
  Notts County kvalificeret til Division Two 1990-91.

Tranmere Rovers kvalificeret til Division Three 1990-91.